お世話になっております。
このところSlackもアップデートが行われたようで、設定が変わってしまうことがあるようです。
もし「チャンネル自体の表示がなくなった!」
とお困りでしたら、添付画像の設定をご確認ください。
フィルターが「アクティブのみ」になっている場合、
一定期間動きのないチャンネルが非表示になってしまうようです。
「すべて」をお選びいただきますと、参加しているすべてのチャンネルが表示されるようになります。
ご不明点や、他にもSlackで困ったことなどがありましたらご連絡ください。
引き続き、どうぞよろしくお願いいたします。